Die Kölner Michaeli Schule arbeitet nach der von Rudolf Steiner erdachten Waldorfpädagogik. In diesem Sinne lebt sie die Wertschätzung jedes Kindes und fördert ihr Schüler geistig, individuell und sozial. Der Lehrplan wird praxisnah vermittelt und umfasst neben den gängigen Fächern auch künstlerische Angebote, wie Zirkus- oder Orchesterarbeit.
Um die Motivation der Kinder aufrecht zu erhalten und das geistige Wohl jedes Einzelnen zu gewährleisten, gehen die Pädagogen sehr einfühlsam und bedacht an ihre Schüler heran. Der gegenseitige Respekt, unabhängig vom Alter, steht hier an erster Stelle. So werden alle Stärken und Schwächen eines jeden Schülers angenommen und akzeptiert.
Außerdem legt die Schule Wert darauf, in engen Kontakt zu den Eltern zu stehen, um eine ideale Erziehung und Unterstützung zu gewährleisten. Dadurch entstehet ein vertrauensvolles, familiäres Verhältnis zwischen Schüler, Pädagoge und Elternteil.